菩提祖师也非常的神秘,在小说之中也就只出现过,教导孙悟空之后就消失了,只有一些辅助作用,孙悟空真正出事的时候,当时就惊动了三界,如来是知道的,他毕竟是佛教的领袖,菩提祖师很有可能也是属于佛教之人,也有人猜测菩提祖师就是如来幻化的,但实际上菩提祖师和如来是两个不同的人。
当年在菩提祖师赶走孙悟空之后,就离开了三星洞,不知所踪,在三界也没有他的人影,同时也没人敢提他的名字,是非常神秘的,当孙悟空学会武功之后,就来到三界闹事关键的时候是如来出手制服了孙悟空。当年就把孙悟空给压到了五行山下,其实还暗地派人去保护了孙悟空。
转世了十世,孙悟空刚好在五行山下五百年,如来之前就说500年后自有人来救你,其实这都在如来的计划之中,如来他身为佛界的领袖,如此做也是想要扩张在三界之中佛界的影响力,把佛法传送人间,让人知道佛力是无边的,从头到尾都是如来安排的一出戏。